在所有rna实验中,最关键的因素是分离得到全长的rna。而实验失败的主要原因是核糖核酸酶(rna酶)的污染。由于rna酶广泛存在而稳定,一般反应不需要辅助因子。因而rna制剂中只要存在少量的rna酶就会引起rna在制备与分析过程中的降解,而所制备的rna的纯度和完整性又可直接影响rna分析的结果,所以rna的制备与分析操作难度极大。
在实验中,一方面要严格控制外源性rna酶的污染;另一方面要最大限度地抑制内源性的rna酶。rna酶可耐受多种处理而不被灭活,如煮沸、高压灭菌等。
外源性的rna酶存在 于操作人员的手汗 、唾液等,也可存在于灰尘中。在其它分子生物学实验中使用的rna酶也会造成污染。这些外源性的rna酶可污染 器械、玻璃制品、塑料制品、电泳槽、研究人员的手及各种试剂。而各种组织和细胞中则含有大量内源性的rna酶。
一、防止rna酶污染的措施
1.所有的玻璃器皿均应在使用前于180℃的高温下干烤6hr或更长时间。
2.塑料器皿可用0.1% depc水浸泡或用氯仿冲洗(注意:有机玻璃器具因可被氯仿腐蚀,故不能使用)。
3.有机玻璃的电泳槽等,可先用去污剂洗涤,双蒸水 冲洗,乙醇干燥,再浸泡在3% h2 o2 室温10min,然后用0.1% depc水冲洗,晾干。
4.配制的溶液应尽可能的用0.1% depc,在37℃处理12h以上。然后用高压灭菌除去残留的depc。不能高压灭菌的试剂,应当用depc处理过的无菌双蒸水 配制,然后经0.22μm滤膜过滤除菌。
5.操作人员戴一次性口罩、帽子、手套,实验过程中手套要勤换。
6.设置rna操作专用实验室,所有器械等应为专用。
二、常用的rna酶抑制剂
1.焦磷酸二乙酯(depc):是一种强烈但不彻di底的rna酶抑制剂。它通过和rna酶的活性基团组an酸的咪唑环结合 使蛋白质变性,从而抑制酶的活性。
2.异硫氰酸胍 :目前被认为是最you效的rna酶抑制剂,它在裂解组织的同时也使rna酶失活。它既可破坏细胞结构使核酸从核蛋白中解离出来,又对rna酶有强烈的变性作用。
3.氧钒核糖核苷复合物:由氧化钒离子和核苷形成的复合物,它和rna酶结合 形成过渡态类物质,几乎能完wan全抑制rna酶的活性。
4.rna酶的蛋白抑制剂(rnasin ):从大鼠肝或人胎盘中提取得来的酸性糖蛋白。rnasin 是rna酶的一种非竞争性抑制剂,可以和多种rna酶结合,使其失活。
5.其它:sds、尿素、硅藻土等对rna酶也有一定抑制作用。
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