ffpe样本-肿瘤病理研究和分子诊断的金标准!
ffpe(formalin-fixed,paraffin-embedding),一般指人类或者动植物组织样本经福尔马林(目前应用最为广泛的固定剂为10%中性福尔马林)固定,石蜡包埋形成的切片或石蜡块。这种方式是目前长期保存病理样本的标准化方法。
福尔马林固定、石蜡包埋(ffpe)组织切片代表了珍贵的生物医学研究材料。ffpe样本堪称为病理科的“瑰宝”,它们承载着众多的疾病信息。
图1.ffpe样本
ffpe样本的制备
ffpe样本提取难点
翌圣生物通过不断地打磨,将ffpe样本dna提取的性能全面升级,采用的磁珠和精心优化的缓冲体系,面对不同降解程度的ffpedna片段,可最大限度的分离纯化高纯度dna,同时可适配自动化提取仪,让提取如此简单!
产品介绍
molpure®magnetic ffpe dna kit (cat#18375es)适用于福尔马林固定、石蜡包埋的组织中提取 dna,可配合翌圣3种不同通量的自动化提取仪auto-pure32a/ap-48/ap-96,实现核酸的高通量提取。
图2:ffpe dna的提取流程
产品优势
提取得率高:提取的基因组完整性好、纯度高,质量稳定可靠;
仪器适配性强:适用于市售各种全自动核酸提取仪进行高通量提取;
安全无毒:使用环保型脱蜡液,较之二甲苯更安全、快速;
适合微量样本dna提取:可提取低至1片5μm的卷片。
产品性能
01评估提取的dna得率、纯度、大片段占比
不同类型的ffpe样本,包括小鼠心脏ffpe样本、肝脏ffpe样本、颈部软组织ffpe样本、甲状腺ffpe样本、肺部ffpe样本,样本的切片厚度为5μm,一次提取2卷;分别采用18375es、竞品1和竞品2提取,每组3个重复;其中18375es搭配翌圣ap-96自动化提取仪,提取的dna用qubit定量浓度,nanodrop定量纯度,qsep100评估大片段的占比。如图3-图5所示,18375es提取的dna得率、纯度、大片段占比都显著优于竞品1和竞品2。
图3.不同ffpe样本提取的 dna得率
图4.不同ffpe样本提取的dna纯度(260/280)
图5.不同ffpe样本提取的dna大片段占比
02标准品(蜡卷)提取的dna突变检出率
采用标准品蜡卷(菁良)分别用18375es、竞品1和竞品2提取dna,dna中含有5% egfr t790m突变和5% egfr l858r突变,各取200ng进行酶切法dna建库(cat#12195es)和杂交捕获,三种试剂盒提取的dna杂交捕获后的数据质量和突变位点检出率如图6所示,18375es和竞品提取的dna文库数据质量相当,突变检出率均在5%左右。
图6.不同ffpe样本提取的dna文库数据质量和突变位点检出率
订购信息
产品名称
产品货号
产品规格
molpure® magnetic ffpe dna kit
磁珠法石蜡包埋组织dna提取试剂盒(瓶装)v2
18375es50
50 t
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产品应用
产品编号
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