pcr电泳条带图的解读方法的探究 首先要从pcr的扩增原理说起:今天小编为您分析归纳,希望对您有用
pcr的原理:pcr的基本过程类似于dna的天然复制,特异性依赖于与靶序列两端互补的oligo引物。整个过程由变性-退火-延伸3个基本反应步骤构成:
1,模板dna变性:模板或经pcr扩增形成的dna经加热至94℃左右一定时间后,双链之间氢键断裂,双股螺旋解链,变成两条单链,以便它与引物结合,为下一轮反应做准备。
2,模板dna与引物的退火(复性):dna加热变性成单链后,当温度降至一定程度(55℃左右)时,引物即与模板dna单链的互补序列配对结合。
3,引物的延伸(72℃):在taq dna聚合酶的作用下,dna模板上的引物以dntp为原料,按a-t、c-g碱基配对与半保留复制原则,合成一条新的与模板dna链互补的链。
重复上述 变性-退火-延伸 的循环过程,每一循环获得的“半保留复制链”都可成为下次循环的模板。通常每完成一个循环需时为2~4min,2~3h就能将靶核酸扩增放大上亿倍(30个循环时,靶产物数量约为10亿)。(注:pcr的第1和第2个循环,并没有短的目的片段,只是在第3个循环后才有,并且有部分双链的长片段将始终伴随整个扩增过程)
下面结合具体事例分析
pcr电泳法应用实例介绍
比如现在有一名高血压患者,我现在要做高血压个性化用药基因检测(点击查看),拟选择卡托普利进行降压,那么需要对ace i/d突变进行检测。经过引物设计(点击查看),最终的野生型目的片段约在200bp左右,由于突变型的目的片段比野生型的多了287bp的插入,那么突变型的片段约在500bp左右。
ace i/d 16号内含子中存在的287bp插入
dna经过pcr的扩增后,我们对扩增的产物进行电泳检测,dna凝胶电泳所需的标准琼脂糖浓度一般为1.0%。浓度越高,小条带的分辨率越高;反之,琼脂糖浓度越低,大分子量条带的分辨率和分离程度越高。
在电场中,中性ph值缓冲液(tae/tbe)下dna都带净负电荷并向凝胶装置正极(+)方向移动(下图中,上为“-极”至下为“+极”),dna分子越大则所受阻力越大,也越难在凝胶孔隙中蠕行,因而迁移得越慢,比如500bp的dna分子比200bp的dna分子迁移就慢。
此外,电泳时需要将dna与荧光染料混匀,结合染料后,dna会在紫外灯下发出荧光,这样才会出现下图中的亮色条带,常用的染料有eb(溴化乙啶)、gel red、sybrgreen1等(有钱建议不要用eb,因为有毒)。
在电泳结束后进行结果解读,我们无法直接判断dna的长度,所以需要在电泳过程将dna产物与dna标准品(dna marker)一起跑电泳,dna marker里面含有若干种长度已知的dna(下图中出现6条亮带的就是dna marker),通过与之比较可以粗略判断dna样品的长度。同时dna marker中的dna片段浓度已知,通过与dna marker的亮度进行比较也能初步判断dna样品的浓度。
结果解读:通过与dna marker比较,如果是野生型,那么就是左边这个图,可发现dna片段长度大小约为200bp,如果是突变型,那么就是右边这个图,突变有纯合突变和杂合突变两种,中间一条500bp的条带即为纯合突变,最右边的200bp及500bp两条条带即为杂合突变,通过pcr及简单的电泳法便可准确的进行ace i/d的检测。
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pcr电泳条带图的解读方法
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