RT-PCR的无扩增产物

可能原因1:引物问题(包括:引物设计较差,引物合成较差,引物浓度太低)。解决方法:设计引物的时候,避免在引物3'端含有互补序列;避免可以形成内部发卡结构的序列;设计tm类似的引物。针对引物合成的问题,用普通电泳法,看引物的设计和合成质量,是否有目的条带出现。最佳引物浓度介于0.1μm到0.5μm之间。可能原因2:探针问题。解决办法:就要用到我们前面提到的序列分析了。用blast对探针序列进行比对,设计符合要求的探针。可能原因3:模板问题(包括:模板质量不好,模板浓度太低)。解决方法:提高模板质量。如果怀疑模板被dmso等抑制剂污染了,坚决采用乙醇沉淀;使用104copy的靶序列,然后在25到30个循环中获得信号。可能原因4:不明物干扰。解决办法:做rt-pcr必须非常小心翼翼。对rt-pcr的任何实验样品或试剂,均应采用“三无”离心管(即无菌无酶无热源)进行试剂的分装和使用。可能原因5:扩增酶问题。解决办法:不要省钱。买好的扩增酶。分子生物学永远是一分价钱一分货。推荐:选择hot starttaq酶进行扩增,可提高灵敏度,增加产量,降低干扰因素。
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