很多老师咨询类器官rna和蛋白如何提取,其实类器官可以按微小组织进行rna和蛋白提取,今天小爱给大家讲一讲提取方法。
类器官蛋白提取方法
一、试剂准备(细胞浆、细胞核及细胞膜蛋白抽提试剂盒(abs9346))
1、准备溶液
1)室温融解试剂盒中的各种溶液,溶解后除结构蛋白提取液外,其他试剂立即置于冰上;
2)结构蛋白提取液溶解后,可放置于37℃水浴中温浴至透明后,常温放置。
2、蛋白提取工作液的准备
1)胞浆蛋白提取工作液的准备:临用前,根据处理样品的量估算实验时胞浆蛋白提取液的需要量,并分别按照1:50比例加入磷酸酶抑制剂ii和1:100比例加入蛋白酶抑制剂pmsf;
2)胞核蛋白提取工作液的准备:临用前,根据处理样品的量估算实验时胞核蛋白提取液的需要量,并分别按照1:50比例加入磷酸酶抑制剂ii和1:100比例加入蛋白酶抑制剂pmsf;
3)膜蛋白提取工作液的准备:临用前,根据处理样品的量估算实验时膜蛋白提取液的需要量,并分别按照1:50比例加入磷酸酶抑制剂ii和1:100比例加入蛋白酶抑制剂pmsf;
4)结构蛋白提取工作液的制备:临用前,根据处理样品的量估算实验时结构蛋白提取液的需要量,并分别按照1:50比例加入磷酸酶抑制剂ii和1:100比例加入蛋白酶抑制剂pmsf。
二、类器官收集及洗涤
1、类器官收集
移液器吸去培养基,每孔添加1-2ml左右4℃类器官传代培养缓冲液(abs9730),轻柔吹打基质胶,收集在15ml离心管中(24孔板,每5孔为一组),4℃静置10min或-20℃放置5min(目的是使基质胶软化),300g ,4℃, 离心5min弃上清。
2、类器官清洗
添加1ml类器官传代培养缓冲液重悬,300g ,4℃,离心5min弃上清。
三、类器官蛋白提取
1、胞浆蛋白提取
1)向含类器官沉淀的ep中加入2ml的胞浆蛋白提取工作液,在4℃条件下震荡20min;
2)准备1-5ml的注射器,用注射器吹打步骤1震荡过的溶液50-90次,在4℃条件下,15000g离心10min。取上清液存于ep管中,即为胞浆蛋白。
2、胞核蛋白的提取
取3.1.2步骤获得的沉淀物加入4ml冰浴的胞浆蛋白提取工作液,在4℃条件下震荡5min,4℃条件下15000g离心10min,弃去上清液,沉淀物中加入1ml冰冻的胞核蛋白提取工作液,在4℃条件下震荡5min,4℃条件下15000g离心10min,上清液为细胞核蛋白,转入ep管并保存。
3、胞膜蛋白的提取
在步骤3.2中的沉淀物中加入1ml冰冻的膜蛋白提取工作液,在4℃条件下震荡5min,4℃条件下15000g离心10min,上清液为细胞膜蛋白,转入ep管并保存。
4、结构蛋白的提取
在步骤3.3的沉淀物中加入常温或37℃水浴过的透明的结构蛋白提取工作液0.5ml,4℃条件下震荡5min,4℃条件下15000g离心10min,保存上清液即为细胞骨架蛋白。
5、待测蛋白的保存待检测浓度的蛋白存于-70℃,可以用于western,emsa,footprinting,报告基因检测以及酶活力测定等后续操作。
类器官rna提取方法
一、类器官收集及洗涤
1、类器官收集
移液器吸去培养基,每孔添加1-2ml左右4℃类器官传代培养缓冲液(abs9730),轻柔吹打基质胶,收集在15ml离心管中(24孔板,每5孔为一组),4℃静置10min或-20℃放置5min(目的是使基质胶软化),300g ,4℃, 离心5min弃上清。
2、类器官清洗
添加1ml类器官传代培养缓冲液重悬,转移到1.5ml ep管,300g ,4℃,离心5min弃上清。
二、类器官rna提取(超纯总rna快速提取试剂盒(含dnase i),货号abs60026)
1、向含类器官沉淀的ep中加入1ml的rl(试剂盒组分)溶解细胞,并用移液枪轻轻吹打混匀,使rl充分和类器官接触裂解细胞并灭活rna酶;
2、将匀浆样品剧烈震荡混匀,在15-30°c条件下孵育5min以使核蛋白体分解;
3、每1ml rl加0.2ml氯仿。盖紧样品管盖,剧烈振荡15sec并将其在室温下孵育3min;
4、于4℃,12000 rpm离心10min,样品会分成三层:下层有机相,中间层和上层无色的水相,rna存在于水相中。水相层的容量大约为所加rl体积的60%,把水相转移到新管中,进行下一步操作;
5、加入1倍体积70%乙醇(请先检查是否已加入无水乙醇!),颠倒混匀(此时可能会出现沉淀)。得到的溶液和可能沉淀一起转入吸附柱ra中(吸附柱套在收集管内);
6、12000 rpm 离心45sec,弃废液,将吸附柱重新套回收集管;
7、加400μl去蛋白液re,12000 rpm 离心45sec,弃废液;
8、dnase i工作液的配制:取10μl dnase i储存液放入新的rnase-free离心管中,加入70μl rdd溶液,轻柔混匀;
9、向吸附柱ra中央加入80μl dnase i工作液,室温放置15min(一般情况下室温放置可得到较好的消化效果,如果室温效果不佳可选择在37℃放置15min);
10、加400μl去蛋白液re,12000 rpm 离心45sec,弃掉废液;
11、加入500μl漂洗液rw(请先检查是否已加入无水乙醇!),12000 rpm离心45sec, 弃掉废液;
12、加入500μl漂洗液rw,12000 rpm 离心45sec,弃掉废液;
13、将吸附柱ra放回空收集管中,12000 rpm离心2min,尽量除去漂洗液,以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应;
14、取出吸附柱ra,放入一个rnase free离心管中,根据预期rna产量往吸附膜的中间部位加50-80μl rnase free h2o(事先在 65℃水浴中加热效果更好),室温放置2min,12000 rpm 离心1min,所得溶液即为rna溶液。如果需要较多rna,可将得到的溶液重新加入离心吸附柱中,离心1min。
提取得到的rna溶液,可以直接应用于northern 杂交、rt-pcr、real time rt-pcr、cdna文库构建、体外翻译等各种常规分子生物学实验。
今天讲解就到这了,大家如有实验问题,欢迎公众号“爱必信生物”后台交流哦!
本期小爱推荐:
货号
品名
规格
abs9346
细胞浆、细胞核及细胞膜蛋白抽提试剂盒
50t
abs60026
超纯总rna快速提取试剂盒(含dnase i)
20t/50t
abs9730
类器官传代培养缓冲液
250ml/ 250ml
abs9495
基质胶(低因子、无酚红)
1.5ml*4/ 1.5ml*8
abs9444
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